El residuo de piña está compuesto ~15% centro del fruto, ~30% corona y ~55% piel. Éste se mezcla con una masa igual de agua antes de un filtrado y centrifugado. El sobrenadante obtenido se somete al pretratamiento enzimático añadiendo un 0,01% de pectinasa de Aspergillus aculeatus (3800 U/mL), ajustando el PH 7. El proceso de filtrado se lleva a cabo por flujo cruzado, con membranas de 75 kDa y 10 kDa de tamaño de poro en la 1ª y 2ª etapa respectivamente. En la 1ª etapa de prefiltración, la bromelina se separa de los compuestos de alta masa molecular y se recupera en el permeado. En la 2ª etapa de purificación, el permeado que contiene bromelina se separa de los compuestos de baja masa molecular, tales como aminoácidos y pigmentos, concentrándose. Para aumentar la eficiencia entre ambas etapas se introduce un paso intermedio de diafiltración. El propósito es diluir primero la bromelina en un diluyente (agua) para mantener un volumen de alimentación constante.