El montaje de los ensayos de biodegradabilidad anaeróbica, se realiza en reactores por tandas (tipo Batch), en los cuales el sustrato se incuba en botellas cerradas por 30 días. El desecho se inocula con un volumen determinado de inóculo y soluciones químicas que permiten el completo desarrollo de las poblaciones bacterianas. Durante el transcurso del proceso, se realizan mediciones periódicas controlando así las variables que influyen en la biodegradación de los desechos. Con los valores medidos durante la digestión, puede simularse un modelo de biodegradación que puede predecir el comportamiento de un sistema a futuro, con base en balances de materia y ecuaciones matemáticas.